Pour clore une décennie d’ouverture thématique, l’IPNL verra se créer en 1999 son groupe Neutrino qui aura d’importantes responsabilités dans l’expérience OPERA (Oscillation Project with Emulsion-tRacking Apparatus) visant entre autres l’observation de l’oscillation neutrino entre le CERN et le site du Gran Sasso en Italie. Depuis 2015, le groupe est impliqué dans l’expérience de nouvelle génération DUNE.